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문의사항

varinat calling 문의
  • 유형 이용문의
  • 상태답변완료
  • 작성자 w********
  • 작성일2025-04-15 15:41:14
  • 조회수36

closha에서 GenotypeGVFs는 따로 제공안하나요? 

WGS 파이프라인을 사용해서 gVCF파일은 얻었는데... vcf파일을 얻을 수 있는 방법이 없을까요?

  • #문의

첨부파일

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답변

 

안녕하세요.

CLOSHA WGS 파이프라인을 이용하실 경우, 기본 출력으로는 gVCF (genomic VCF) 형식의 결과 파일이 제공됩니다.
현재 해당 파이프라인에서는 Genotype된 VCF 파일(일반 VCF)은 별도로 생성되지 않습니다.

이에 따라, gVCF 파일을 기반으로 VCF 파일을 생성할 수 있도록 해당 기능을 CLOSHA 시스템에 탑재하여 제공해드릴 예정입니다.

관련 기능이 적용되는 대로 별도 안내드릴 수 있도록 하겠습니다.

감사합니다.

 

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안녕하세요.

 

바이오익스프레스 개발팀입니다.

 

요청하신 GenotypeGVCFs 탑재가 완료되었습니다.

 

프로그램은 Bioinfromatics > Whole-Genome-Sequencing 하위에 위치하고 있습니다.

 

사용 중 문의사항이 발생하면 언제든지 연락해주세요.

 

감사합니다.

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